SULM – Schweizerische Union für Labormedizin | Union Suisse de Médecine de Laboratoire | Swiss Union of Laboratory Medicine

Aktuelle Ausgabe | Numéro actuel

Nr. 6/2018 Die Analyse der Darmflora | Analyse du microbiote

Inhaltsverzeichnis | Sommaire

Editorial
Gilbert Greub
Die Analyse der Darmflora | Analyse du microbiote (pdf)
Bien qu’initialement la plupart des travaux sur le microbiote ont émané du secteur de la recherche fondamentale, l’analyse du microbiote est arrivée en microbiologie médicale diagnostique. C’est dans ce contexte que le premier article de ce numéro spécial précise ce qu’est la métagénomique et décrit l’importance des approches qualité afin de rendre des résultats fiables en utilisant ces nouvelles technologies. Le deuxième article de ce numéro spécial décrit l’utilité de l’analyse du microbiote des selles pour étudier le métabolisme du lactose. C’est un bon exemple de possibles applications médicales futures et démontre que la microbiologie, d’une discipline principalement au service du diagnostic des maladies infectieuses s’étant à de nombreuses autres disciplines…

Theme
Gilbert Greub, Marta Rosikiewicz, Claire Bertelli
Mikrobiota-Analyse in einem diagnostischen Labor: Definitionen, Anwendungen und Qualitätsaspekte | Analyse du microbiote dans un laboratoire diagnostic : définitions, applications et aspects qualité (pdf)
Durant ces 10 dernières années, plusieurs nouvelles technologies ont été introduites dans les laboratoires diagnostiques permettant d’obtenir plus d’informations, plus rapidement. Outre le MALDI-TOF, introduit dans la plupart des laboratoires en 2009, et l’automatisation qui s’est étendue progressivement des laboratoires de sérologie aux laboratoires de biologie moléculaire et de microbiologie classique (microscopique et culture), l’avènement du séquençage à haut débit a également permis d’obtenir plus d’informations sur la composition microbienne dans un champ donné et ce de manière suffisamment rapide et fiable pour devenir un outil de l’arsenal diagnostique. A Lausanne, nous avons développé la génomique bactérienne et l’analyse du microbiote dès le début de l’année 2012 et avons pu accréditer notre laboratoire de génomique bactérienne et métagénomique cette année. Cet effort d’accréditation nous a permis d’établir les applications diagnostiques du séquençage à haut débit et de définir précisément les protocoles d’analyse.

Gilbert Greub, Marta Rosikiewicz, Claire Bertelli
Analyse du microbiote dans un laboratoire diagnostic : définitions, applications et aspects qualité (pdf)

Kathryn J Burton
Laktoseverdauung und die Auswirkungen auf die Darmflora | Lactose digestion and the implications on the gut microbiota (pdf)
Lactose digestion in humans depends upon the activity of the enzyme lactase. In adults, lactose maldigestion is often present due to a physiological decline in lactase expression in late childhood. Lactose maldigestion can lead to symptoms of lactose intolerance due to the presence of undigested lactose in the colon and the products of its fermentation by gut bacteria. Adaptive changes in the colonic microbiota are associated with decreased lactose intolerance…

Valentin Scherz, Claire Bertelli, Cristian Palmiere, Franco Taroni, Gilbert Greub
Mikrobiota und forensische Medizin: ein neues Beweismittel? | Microbiote et médecine forensique: une nouvelle évidence? (pdf)
L’analyse du microbiote par des techniques de séquençage est en plein essor essentiellement à des fins de recherche, mais les applications diagnostiques impactant positivement la prise en charge du patient restent à développer et à valider. Le Laboratoire de génomique et métagénomique de l’Institut de microbiologie de l’Université de Lausanne au CHUV collabore sur deux nouvelles applications avec l’Ecole des sciences criminelles de l’Université de Lausanne et le Centre universitaire romand de médecine légale (CURML).…

Claire Bertelli, Gilbert Greub
Vom Trinkwasser zum Abwasser: Mikrobiota und Antibiotikaresistenz | De l’eau potable aux eaux usées : microbiote et antibiorésistance (pdf)
La métagénomique permet d’étudier les communautés microbiennes colonisant les systèmes de distribution d’eau potable ou de traitements des eaux usées, offrant de nouvelles perspectives pour assurer à la population une eau de qualité dans les robinets, les lacs et les rivières…

Pilar Junier, Christophe Paul, Thomas Junier
Sedimentmikrobiota: neuartiger Ansatz zur Rückverfolgung der Antibiotikaeinnahme in der Vergangenheit | Le microbiote du sédiment: une approche novatrice pour tracer la consommation passée d’antibiotiques (pdf)
La découverte des antibiotiques comme moyen de lutte contre les infections bactériennes fait partie des grands succès médicaux du XXe siècle. La pénicilline a été d’une telle importance pour l’humanité qu’elle a conduit à l’octroi de deux Prix Nobel, d’abord à l’équipe responsable de sa production (1945, Prix Nobel de médecine), ensuite à la chimiste ayant élucidé sa structure (1964, Prix Nobel de chimie)…

Gilbert Greub
Sur les traces d’Hannibal (pdf)
En 218 avant J.-C., Hannibal de Carthage était à la tête de l’armée punique et a envahi l’Italie à partir du bassin du Rhône en traversant les Alpes avec des milliers de chevaux, beaucoup d’éléphants et un nombre considérable de soldats (réf. 1). Cependant, la route qu’a empruntée Hannibal de Carthage reste peu claire…

News
Gilbert Greub
Congrès annuel de la Société suisse de microbiologie (SSM) 2018 (pdf)
Le congrès de la Société suisse de microbiologie a eu lieu du 28 au 30 août 2018. Ce congrès coorganisé par Stefan Kunz et Gilbert Greub avec l’aide de Sabine Gisler et Nicole Giacomini de Meeting.com a été une superbe opportunité d’échanger entre collègues microbiologistes, et avec d’autres scientifiques de domaines proches. Ce fut aussi l’occasion de découvrir de nouvelles technologies permettant de détecter et/ou d’identifier des microbes et de discuter leur possible impact clinique. De plus, les participants au meeting ont pu échanger sur de récentes découvertes permettant de mieux comprendre la biologie des microbes et leur évolution ainsi que l’impact sur la biologie des micro-organismes…

Gilbert Greub
KROBS: ein innovatives Spiel über Mikroben | KROBS: un jeu innovant sur les microbes (pdf)
Jouer est un moment unique de partage et d’interaction qui pour la plupart d’entre nous nous rappelle les moments magiques de notre enfance. En effet, les jeux sont largement présents dans l’univers des enfants, leur permettant de se développer à la fois en termes de compétences et de savoir-être. Le jeu KROBS est un jeu innovant permettant de développer la conscience du grand public sur certains pathogènes et bien qu’accessible aux enfants dès 8 ans, il plaît aussi aux adultes et sert d’ailleurs de soutien à l’enseignement à l’école supérieure de la santé et à l’école de médecine…

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